Essas terras mais tarde passaram a pertencer a Domingos Machado Homem e sua mulher Joana Barcelos. O território recebeu o nome de “FAZENDA DE SÃO MATHEUS” em homenagem ao filho do casal padre Mateus Machado Homem.

A partir de 1621 está na posse de João Álvares Pereira que em 1637 constrói a Capela de São Matheus. Durante 140 anos, a Fazenda passou pelas mãos de muitos donos e em 1779 pertencia ao Alferes Ambrósio de Souza, o maior produtor de açúcar e aguardente, fabricando 30 caixas de açúcar e 14 pipas de aguardente anualmente, com seus 50 escravos. Era uma das fazendas mais prósperas da Corte.

Estas terras conhecidas inicialmente como Engenho de São Matheus passam a ser Fazenda de São Matheus, pertencendo à sucessão de João Álvares Pereira, que dominou por 263 anos, vindo, finalmente, em 1866, a pertencer ao Sr. Jerônimo de Mesquita, o primeiro Barão de Mesquita. Os imóveis construídos por ele, até hoje existem.

Durante muito tempo, essas terras foi motivo de grandes riquezas, devido à fertilidade do solo e a mão de obra barata do escravo.

Com a chegada da via férrea, em 1858, houve um abandono dos rios, que não mais interessavam para transportar os produtos dos engenhos e lavouras existentes na área. Com o abandono e com a devastação criminosa, a margem dos rios ficou sem vegetação e cada vez mais invadida por terras,  o que gerou uma queda no progresso e nas riquezas da região.

Porém, a partir de 1900 passa a pertencer a João Alves Mirandela que em fins de 1913 resolve lotear a área, nascendo a futura cidade de Nilópolis. O território  recebeu o nome de “FAZENDA DE SÃO MATHEUS” em homenagem ao filho do casal padre Mateus Machado Homem.

O loteamento começou a ser ocupado no início de 1914, sendo fundada a cidade no dia 06 de setembro de 1914, pelo Coronel Júlio de Abreu, que construiu a primeira casa de alvenaria.

Com o loteamento em 1914, iniciou-se com intensidade o povoamento de SÃO MATHEUS. Nesta mesma época a Estrada de Ferro Central do Brasil construiu e inaugurou uma parada de trens na região com o nome de Engenheiro Neiva. Assim, com o acesso mais fácil e os lotes que eram vendidos de forma facilitada (prestações mensais), a região passou a ser procurada por operários e pequenos empregados, formando-se um povoado grande e com movimento comercial promissor.

O povoado que pertencia a São João de Meriti, a partir de 09/11/1916 passa a ser o 7º distrito de Nova Iguaçu, já a caminho de sua independência.

Com a criação do Bloco Progresso de Nilópolis  passou a ter todos os seus serviços como água, luz, telefone, escolas e os demais melhoramentos, graças ao apoio de Nilo Peçanha, de todos os seus amigos políticos, comerciantes, industriais, banqueiros e etc…, que resolveram ajudar no crescimento da cidade.

O povoado teve o nome de São Matheus; Engenheiro Neiva e Nilópolis, a partir de 1921, em homenagem ao Presidente da Republica Nilo Peçanha. A homenagem foi feita em agradecimento a Nilo Peçanha, que inclusive visitou a região e graças a sua ação enérgica deu início ao saneamento básico da região solucionando assim, definitivamente o problema das margens dos rios e da vegetação.

Sua população e serviços públicos tiveram excelente crescimento, com a participação efetiva no consenso da baixada.

Com a instalação da Assembléia Legislativa em 1945, e havendo a necessidade de se ter uma nova constituição para o Estado do Rio de Janeiro, o então  Deputado Estadual  Lucas de Andrade Figueira, representando Nilópolis naquela casa, apresentou emenda que recebeu o número 6 à referida constituição, criando o município de Nilópolis, juntamente com o de São João de Meriti. Promulgada a mesma, foi o mesmo instalado no dia 21 de Agosto de 1947, que com sua autonomia estava capacitado a ter eleição de Prefeito e Vereadores; ter sua própria Comarca e outros serviços essenciais de que todas as cidades precisam.

Seu primeiro prefeito eleito foi João de Moraes Cardoso Júnior, que por mais duas vezes exerceu o cargo, tendo sido sucedido  por outros, através de eleições democráticas.

Emancipado pela Lei Estadual nº 6 de 11 de agosto de 1947, de autoria do Deputado Estadual Dr. Lucas de Andrade Figueira, Emendando o Artigo 6º do Ato das Disposições Transitórias da Constituição Estadual de 1947.

Em 21 de agosto de 1947, foi instalado solenemente o município de Nilópolis, com a posse do Doutor Pedro da Silva Pontes, alto funcionário Estadual, nomeado pelo Governador do Estado do Rio de Janeiro, Cel. Edmundo de Macedo Soares, para governar o Município até a primeira eleição a 28 de setembro do mesmo ano, sendo substituído pelo Sr. Antônio José de Oliveira que transmitiu o cargo ao Primeiro Prefeito Eleito, Sr JOÃO MORAES CARDOSO JR , UDN – 2.269 VOTOS.

Nilópolis que já tinha uma boa infra-estrutura, depois da emancipação, foi num crescendo assustador, merecendo as melhores referências como a cidade do progresso, tendo em seu território as mais importantes lojas, filiais do Rio de Janeiro; excelente rede bancária; suas ruas em sua quase totalidade asfaltadas; sem problemas de valas abertas; água, luz e telefones; como também uma ótima rede de ensino de todos os graus; um moderno hospital – uma rede de postos de saúde, e tendo sido considerada entre as cinco cidades melhores no que se refere ao ensino e na qualificação de vida, conferido pela Unicef.

Agora vem se destacando na cultura e no esporte, sem se esquecer  que tem a maior Escola de samba da Baixada: A Beija-Flor de Nilópolis.

Capela São Matheus

Data de Fundação: 21 de agosto de 1947
Gentílico: nilopolitano
Área: 19,157 Km²
Altitute: 16 m
Distância da Capital: 22 Km
População: 153.712 (CENSO 2000) – 150.475 (Estimada julho/2006)
Eleitores:  110.994 (TSE maio/2006)
IQM-2000: Classificação Estadual: 49
IDH-2000: Classificação Estadual: 19
Municípios Limítrofes: São João de Meriti, Rio de Janeiro e Mesquita
Principais Rios: Rio Pavuna
Principais Atividades Econômicas: Indústria, Comércio (relevante) e Prestação de Serviços
Padroeira: Nossa Senhora da Conceição (8/12)